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VA: Die Zukunft der Theoretischen Biologie

Schreiber, Susanne, Prof. Dr. rer. nat. (Theoretische Neurophysiologie)

Laufzeit: 05/2017 - 12/2017

Internationale Konferenz zu aktuellen Entwicklungen und der Zukunft der Theoretischen Biologie.

Strukturelle und funktionelle Analyse der Interaktion zwischen Kinetochor und zentrometrischem Chromatin in Saccharomyces cerevisiae

Kshirsagar, Rucha, Dr. Ph.D. (Molekulare Zellbiologie)

Laufzeit: 10/2018 - 07/2023

SPP 1926/1: Entwicklung und Anwendung neuer optogenetischer Werkzeuge in spezifischen intrazellulären Kompartimenten

Hegemann, Peter, Prof. Dr. (Experimentelle Biophysik)

Laufzeit: 09/2016 - 01/2019

Ziel unserer Arbeiten im Rahmen dieses Projektes ist es, neue optogenetische Anwendungen zur Erforschung subzellulärer Kompartimente zu entwickeln. Im ersten Teilprojekt werden wir lichtgesteuerte Protonen- und Chloridkanäle bzw. Chloridpumpen mit Ta ...

SPP 1623: Peptidtemplat-gesteuerte Biokonjugation an Proteinen in und auf lebenden Zellen für Untersuchungen von GPCR-Transport und -Kreuzreaktivität

Seitz, Oliver, Prof. Dr. rer. nat. (Organische und Bioorganische Chemie III)

Laufzeit: 02/2016 - 06/2019

Die Aktivität von G-Protein-gekoppelten Rezeptoren hängt von ihrer Lokalisation in der Zelle, der Rezeptordichte und ihrer Mobilität in der Membran ab. Für einige Rezeptoren ist eine essentielle Dimerisierung bekannt, bei anderen wird sie vermutet od ...

SPP 1617: Heterogenität der Matrix-Produktion bei der bakteriellen Filmbildung

Hengge, Regine, Prof. Dr. (Mikrobiologie)

Laufzeit: 07/2015 - 12/2019

Bakterielle Biofilme zeigen räumliche physiologische Differenzierung, die Nährstoff- und/oder Sauerstoffgradienten folgt. Fluoreszenz- und EM-Analysen von Kryoschnitten durch Makrokoloniebiofilme von E. coli zeigen eine klare Stratifizierung mit wach ...

Singlet Molecular Oxygen and Photodynamic Effects (PDE)

Röder, Beate, Prof. Dr. rer. nat. habil. (Experimentelle Physik (Photobiophysik))

Laufzeit: 05/2017 - 07/2017

The 2nd Chinese-German Workshop on Singlet Oxygen and Photodynamic Effects will be held on 30th March until 2nd June 2017, in Berlin the capital of Germany, which is a completely independent meeting. The aim is to provide a bilateral scientific and t ...

Single-Shot-Spektrometer für zeitaufgelöste simultane Vis- und IR-Messungen

Hegemann, Peter, Prof. Dr. (Geschäftsführendes Direktorat)

Laufzeit: 07/2016 - 12/2019

Ziel des Projektes ist der Aufbau eines neuartigen Messplatzes an der IRIS-Beamline des BESSY II für die simultane, Mikrosekunden-zeitaufgelöste Infrarot-(IR-) und Elektronenabsorptions- (UV/ Vis)Spektroskopie nicht-zyklischer Systeme zur Durchführun ...

SFB-TRR 186/1: Optische Kontrolle von Calcium-Schaltern zur Orchestrierung schneller Signalprozesse im Gehirn (TP A07)

Hegemann, Peter, Prof. Dr. (Experimentelle Biophysik)

Laufzeit: 07/2016 - 06/2020

Der zytoplasmatische Anstieg von Calcium im Gehirn aktiviert enzymatische Kaskaden, die für die synaptische Plastizität des Gehirns verantwortlich sind. Aber bis heute fehlen genetisch kodierte Ansätze zur Kontrolle der Ca-Dynamik sowie Kenntnisse de ...

SFB/TRR 175/1: Von prädikativen zu mechanistischen Modellen der plastidären Genexpression mittels Hochdurchsatz-Sequenzdaten (TP D01)

Ohler, Uwe, Prof. Dr. (Systems Biology of Gene Regulation (S))

Laufzeit: 07/2016 - 06/2021

Aktuelle Sequenziertechnologien und weitere –omics Methoden liefern wichtige Daten um zu verstehen, wie Akklimatisationsprozesse auf verschiedenen Ebenen der Genregulation gesteuert werden. Zur Integration dieser Daten werden wir ein hierarchisches M ...

SFB-TRR 175/1: Subzelluläre Modellierung metabolischer Akklimatisation (TP D03)

Klipp, Edda, Prof. Dr. rer. nat. Dr. h.c. (Theoretische Biophysik)

Laufzeit: 07/2016 - 12/2020

Die Kälteakklimatisation bei Pflanzen umfasst zahlreiche biochemische Prozesse. Hierbei spielt die Kompartimentierung primärer und sekundärer Stoffwechselprodukte eine wichtige Rolle. In unserem Projekt kombinieren wir subzelluläre Hochdurchsatzanaly ...

SFB/TRR 175/1: Exploring Possibilities of Embedding Chlamydomonas Dry Mass into concrete and other building materials to create a Carbon Dioxid Trap – Mini-Projekt

Krantz, Maria, (Theoretische Biophysik)

Laufzeit: 10/2019 - 12/2019

SFB 1404/1: Datenanalyseworkflows für die interaktive Exploration naturwissenschaftlicher Daten (TP A06)

Weidlich, Matthias, Prof. Dr. (Datenbanken und Informationssysteme)

Laufzeit: 07/2020 - 06/2024

Die Analyse von wissenschaftlichen Daten ist oft explorativer Natur, was sich auch in der Spezifikation von DAWs widerspiegelt. Typischerweise wird ein DAW iterativ erstellt und schon während seiner Entwicklung kontinuierlich angepasst, um den Result ...

SFB 1404/1: Adaption von Datenanalyseworkflows der Genomforschung auf unterschiedliche Datenzugriffsmuster (TP A02)

Leser, Ulf, Prof. Dr.-Ing. (Wissensmanagement in der Bioinformatik)

Laufzeit: 07/2020 - 06/2024

Die Laufzeit von DAWs auf naturwissenschaftlichen Messdaten wird in der Regel durch die notwendigen Operationen zum Datenzugriff und zum Datenaustausch bestimmt. Deren Laufzeit wiederum ist abhängig von den Daten, die analysiert werden, den Programme ...

SFB 1078: Proteinfunktion durch Protonierungsdynamik

SZF-1, Leitung Servicezentrum Forschung, (Servicezentrum Forschung (SZF))

Laufzeit: 01/2013 - 12/2020

Wie funktionieren Proteine? Welche Mechanismen wirken bei der Steuerung von Prozessen durch Proteine? Diese Fragen werden in den molekularen Lebenswissenschaften durch Forschungsarbeiten in den Grenzbereichen von Biologie, Chemie und Physik adressier ...

SFB 1078/2: Spektroskopische Untersuchungen von Protonentransferprozessen und wasserstoffgebundenen Netzwerken in Channelrhodopsinen und Phytochromen (TP B05)

Bartl, Franz, Prof. Dr. (Biophysikalische Chemie)

Laufzeit: 04/2017 - 12/2020

Der Fokus in diesem Projekt liegt auf der Untersuchung verschiedener Vertreter von Channelrhodopsinen und Phytochromen. Ziel ist es, die Fotochemie und die Protonierungsdynamik, welche diesen Fotozyklen und damit letztlich der Funktion dieser Fotorez ...

SFB 1078/1: Strukturelle Grundlagen der Protonenabgabe in der Wasser-Oxidation durch das Photosystem II (TP A05)

Zouni, Athina, (Experimentelle Biophysik)

Laufzeit: 01/2013 - 03/2021

In der oxygenen Photosynthese wird Wasser oxidiert und Di-Sauerstoff am Mn4Ca Komplex des Photosystems II (PSII) gebildet, einem 750 kDa großen Protein-Kofaktor-Komplex, der in die Thylakoidmembran von Pflanzen und Cyanobakterien eingebettet ist. Aus ...

SFB 1078/1: Strukturelle Grundlagen der Protonenabgabe in der Wasser-Oxidation durch das Photosystem-II: Kristallisation, Röntgen- und Neutronenbeugungsanalyse von Chlorid-modifizierten und ortsgerichteten Varianten (TP A05)

Dobbek, Holger, Prof. Dr. rer. nat. (Strukturbiologie / Biochemie)

Laufzeit: 01/2013 - 12/2020

In der oxygenen Photosynthese wird durch Oxidation von Wasser am Mn4Ca Komplex des Photosystem-II (PSII) molekularer Sauerstoff gebildet. Während der letzten zehn Jahre konnte die Auflösung der Struktur des PSII kontinuierlich verbessert werden. Dies ...

SFB 1078/1: Structural Dynamics of Channelrhodopsins (TP B01)

Hegemann, Peter, Prof. Dr. (Experimentelle Biophysik)

Laufzeit: 01/2013 - 12/2020

The proposed project aims at an elucidation of the mechanism governing ChR gating and transport. For the understanding of protonation dynamics that occur during activation (gating) of the channel and during transport of the ions across the membrane, ...

SFB 1078/1: Gating und Ionentransportdynamik in Kanalrhodopsinen und in lichtgetriebenen Ionenpumpen (TP B02)

Hegemann, Peter, Prof. Dr. (Experimentelle Biophysik)

Laufzeit: 01/2013 - 12/2020

Während der letzten Förderperiode haben wir Anionen-leitende Kanalrhodopsine (ACRs) charakterisiert mit Fokus auf die im Tara Ocean-Projekt identifizierte Familie der MerMAIDs. In dieser Förderperiode werden wir die MerMAIDs weiter charakterisieren u ...

Regulation der Kinetochorfunktion in Hefe durch Modifikation der Kernregion des zentromerischen Nukleosoms

Ehrenhofer-Murray, Ann, Prof. Dr. (Molekulare Zellbiologie)

Laufzeit: 02/2020 - 07/2023

Zentromere sind die Regionen des Chromosoms, an denen das Kinetochor assembliert wird, und sie stellen eine physische Verbindung zwischen dem Centromer-Chromatin und den Mikrotubuli dar, die für die Chromosomensegregation bei der Mitose benötigt wird ...

NW/3: Kollektive Informationsverarbeitung – Von individueller sensorischer Verarbeitung zum Schwarmverhalten und kollektiven Entscheidungsprozessen

Romanczuk, Pawel, Dr. (Nachwuchsgruppen)

Laufzeit: 11/2020 - 10/2021

Das Hauptziel des Projektes ist die Entwicklung und Untersuchung neuer individuum-basierter mathematischer Modelle für Schwarmverhalten, die explizit den proximaten Mechanismus der sozialen Interaktion - die sensorische Wahrnehmung - mit beschreiben. ...

NW/2: Kollektive Informationsverarbeitung – Von individueller sensorischer Verarbeitung zum Schwarmverhalten und kollektiven Entscheidungsprozessen II

Romanczuk, Pawel, Dr. (Nachwuchsgruppen)

Laufzeit: 05/2019 - 08/2021

Das Hauptziel des Projektes ist die Entwicklung und Untersuchung neuer individuum-basierter mathematischer Modelle für Schwarmverhalten, die explizit den proximaten Mechanismus der sozialen Interaktion – die sensorische Wahrnehmung – mit beschreiben. ...

NW/1: Kollektive Informationsverarbeitung – Von individueller sensorischer Verarbeitung zum Schwarmverhalten und kollektiven Entscheidungsprozessen

Romanczuk, Pawel, Dr. (Nachwuchsgruppen)

Laufzeit: 06/2016 - 04/2021

Das Hauptziel des Projektes ist die Entwicklung und Untersuchung neuer individuum-basierter mathematischer Modelle für Schwarmverhalten, die explizit den proximaten Mechanismus der sozialen Interaktion – die sensorische Wahrnehmung – mit beschreiben. ...

Zouni, Athina, PD Dr. (Honorar- und außerplanm. Profess. / Privatdoz. / Lehrbeauftragte)

Laufzeit: 08/2013 - 10/2017

Im Rahmen des Tandemvorhabens sollen lichtaktivierbare Elektrodenaufbauten für die biokatalytische Synthese entwickelt werden. Hierzu sollen zunächst Photosysteme oder -Komponenten mit Elektroden derart kombiniert werden, dass ein effektiver Photoele ...

Nachweis und funktionelle Charakterisierung von Queuosin und m5C Modifikationen in RNA

Ehrenhofer-Murray, Ann, Prof. Dr. (Molekulare Zellbiologie)

Laufzeit: 11/2018 - 04/2022

tRNAs tragen eine Vielzahl von chemischen Modifikationen, welche die Funktion der tRNAs in der Translation modulieren. In diesem Projekt untersuchen wir zwei dieser Modifikationen, Queuosin (Q) und 5-Methylcytosin (m5C). Unsere Vorarbeiten mit der Sp ...